Arrêtés pour violation des lois sur la circulation spatiale, Chiharu, la « super-humaine » génétiquement améliorée, et Makina, la cyborg, sont condamnées à effectuer des travaux d'intérêt général aux côtés d'autres détenus à bord du Milky☆Subway, un train utilisé pour les voyages interplanétaires. Lorsque le train est soudainement activé, le groupe doit résoudre la situation avant qu'elle ne dégénère en incident intergalactique.
